AI模型搜寻癌症线索速度远超以往
瑞典哥德堡大学团队开发了一种人工智能(AI)模型,模型通过糖分析增加检测癌症的搜寻速度可能性。与当前的癌症半手动方法相比,AI模型能在几秒钟内准确发现异常。线索研究结果发表在新一期《自然·方法学》杂志上。远超 聚糖或糖分子的模型结构普遍存在于人体细胞中,可通过质谱仪测量。搜寻速度这些结构的癌症一个重要的用途就是可指示细胞中不同形式的癌症。然而,线索从质谱仪测量的远超数据必须由人来仔细分析,这一过程可能需要数小时至数天,模型且只能由少数专家进行。搜寻速度因此,癌症当有大量样品需要分析时,线索这一漫长过程就成为甘聚糖分析法的远超一个瓶颈。 鉴于此,研究团队开发了一个AI模型“Candycrunch”来自动完成这项筛查工作。该AI模型每次测试只需几秒钟即可完成。团队使用超过50万个不同的片段和糖分子相关结构的数据库,对AI模型进行了训练。这种训练使“Candycrunch”能在90%的案例中,极其快速准确地计算出样本中糖的精确结构。“Candycrunch”也能识别由于低浓度而经常被人类分析遗漏的结构。因此,该模型可帮助科学家找到新的基于聚糖的生物标志物。 研究团队认为,利用AI模型检测癌症,很快可达到与其他生物序列(如DNA、RNA或蛋白质)测序相同的精度水平。 除此之外,由于AI模型的“答案”如此快速和准确,不仅可加速糖基生物标志物的发现,还可应用于癌症的诊断和预后。研究团队相信,甘聚糖分析将成为生物学和临床研究中一个更大的组成部分。
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