基于血清药物化学与网络药理学探究麝香通心滴丸治疗冠心病的机制(三)
3.2麝香通心滴丸入血成分网络药理学研究 3.2.1作用靶点预测 将麝香通心滴丸8个入血成分上传至PharmMapper数据库后得到的基于究麝所有靶点,删除重复并整合得到作用靶点249个。血清学探香通心滴心病通过与GeneCards数据库中的药物药理1 778个与冠心病相关基因进行匹配,并通过R软件绘制韦恩图,化学筛选出134个成分-疾病交集靶点,网络丸治见表2、疗冠图10。基于究麝再通过Cytoscape 3.7.1软件将8个入血成分与134个成分-疾病交集靶点相连,血清学探香通心滴心病绘制出麝香通心滴丸的药物药理药物-靶点相互作用的网络图,见图11。化学 3.2.2蛋白相互作用网络构建与分析 将韦恩图得到的网络丸治134个交集基因输入String数据库中进行分析得到PPI图,见图12,疗冠其中包括134个节点,基于究麝347条边,血清学探香通心滴心病平均节点度值为5.18,药物药理PPI富集P值少于1.0×1016,其中节点表示蛋白,每条边则表示蛋白与蛋白之间的相互作用关系,线条越多表示关联度越大。将String中下载的tsv文件用R语言进行处理(以各蛋白连接的节点个数为指标,列举节点数排名前30个的蛋白),得到PPI中的核心基因丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、酪氨酸激酶(SRC)、磷脂酰肌醇3激酶(PIK3R1)等核心基因,见图13。 3.2.3靶标GO富集分析及通路富集分析结果 利用David 6.7平台对134个药物-疾病交集靶点进行GO富集分析及通路富集分析。GO富集分析包括分子功能分析、细胞组分分析、生物学过程分析,以-lgP值进行排名并列出排名前15的途径,见图14。在分子功能层面主要涉及类固醇激素受体活性、配体依赖性核受体活性等方面;在细胞组分层面主要涉及细胞外基质、细胞质、细胞质囊泡等方面;生物学过程层面主要涉及有机物质的反应、内源性刺激的反应、激素刺激的反应、调节细胞增殖等方面。对富集得到的通路结果,以-lgP值及各通路连接的基因数从大到小进行排名,见图15。通过查阅文献,该8个入血成分可能通过ErbB signaling pathway、VEGF signaling pathway、PPARsignaling pathway等信号通路治疗冠心病。 3.2.4分子对接 将上述8个入血成分与上述互作关系排名前10的核心靶点进行分子对接,结果见表3,结合能(affinity)越小则对接结果越好,affinity<-7表示具有较好的结合活性,可见该8个入血成分与大多数核心靶点对接结果基本较好。其中,去乙酰华蟾毒精与MAPK1结合活性最高,其分子对接细节模拟见图16,可知小分子结合在蛋白的活性口袋,并且有和活性口袋有较好的匹配。 声明:本文所用图片、文字来源《中成药》2020年10月,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系 相关链接:蛋白,磷脂酰肌醇,类固醇,结合
-
上一篇
-
下一篇
- 最近发表
- 随机阅读
-
- 难固定、易脱落、隐患多 家用单杠不是神器是凶器
- 2015年度中国计量测试学会科学技术进步奖揭晓
- 质检总局高效办理二○一五年全国两会二百六十件建议提案
- 质检总局加强国庆期间特种设备安全监察
- 泉州交警持续严查飙车、竞速、“炸街”等行为
- 在食品违法案件中,关于货值的金额和违法所得能否按照《产品质量法》规定来认定?市场监管总局回复
- 2016年全国质检系统执法打假工作会议在京召开
- 质检总局:为党的十九大提供有力有效的保密服务保障
- 水质锰(标样):为水质锰含量检测提供可靠基准
- 在对产品检测结果存在争议时,检验方法是按企业标准中的规定执行还是按相应的推荐性国标或行标中的规定执行?市场监管总局回复
- 质检总局会同国家旅游局开展旅游服务质量提升活动
- 国家药监局发布药品说明书适老化及无障碍改革试点方案
- 上好“开学第一课” 全面迎接新学期
- 七部门关于印发《有色金属行业稳增长工作方案》的通知
- 中国造船质量标准助推造船业质量提升
- GB中非强制性条款是否必须执行?市场监管总局作出回复
- 2,5—二甲基—3—乙酰硫基四氢呋喃立体异构体制备及香气特征(三)
- 中国特检院开展特设保障性检验助力G20杭州峰会
- 第48届国际质量管理小组会议圆满落幕
- 新加坡暴发寨卡疫情 质检总局加强口岸防控
- 搜索
-
- 友情链接
-