MIMOSA 用于分子优化的多约束分子采样
为了发现新药,设计新分子很重要。采样分子优化是用于从输入分子中寻找具有改善药物特性的分子的尝试。arXiv.org上的分优一篇最新论文提出了一种基于采样的策略来优化分子的多个特性。 名为MultI约束分子扩增(MIMOSA)的多约框架使用输入分子作为初始猜测。然后,束分在分子拓扑结构和子结构类型预测(子结构可以是采样原子或环)上训练了两个图神经网络。通过添加,用于替换或删除子结构来生成新分子。分优 马尔可夫链蒙特卡罗方法用于选择有希望的多约候选者用于下一次迭代。在优化溶解度和生物活性时,束分MIMOSA的采样分子优化性能超过了几个最先进的基准。 分子优化是加速药物发现的基本任务,其目标是生成新的有效分子,该分子在保持与输入分子相似性的同时,最大化多种药物的特性。现有的生成模型和强化学习方法取得了初步的成功,但是在同时优化多种药物特性方面仍然面临困难。为了解决这些挑战,我们提出了多重约束分子简化(MIMOSA)方法,这是一种使用输入分子作为初始猜测并从目标分布中采样分子的采样框架。MIMOSA首先为分子拓扑和子结构类型预测预训练两个属性不可知图神经网络(GNN),其中子结构可以是原子或单环。对于每次迭代,MIMOSA使用GNN的预测,并采用三种基本的子结构操作(添加,替换,删除)来生成新分子和相关权重。权重可以编码多个约束,包括相似性和药物特性约束,然后我们选择有希望的分子进行下一次迭代。MIMOSA可以灵活编码多个属性和相似性约束,并可以有效地生成满足各种属性约束的新分子,并且就成功率而言,相对于最佳基准可以实现高达49.6%的相对改进。MIMOSA 用于分子优化的用于多约束分子采样
桑琴蓉导读 为了发现新药,设计新分子很重要。分优分子优化是多约从输入分子中寻找具有改善药物特性的分子的尝试。arXiv org上的束分一篇最新论文提出了一种基于采
- 最近发表
- 随机阅读
-
- 彩票管理条例昨起实施
- 哈瑪斯突襲以色列讓世人目光移回巴勒斯坦,重挫美國推動以沙關係正常化
- 美國經濟與貨幣政策:升息時候到了嗎?
- 杭州亞運10/5賽事一覽:林郁婷爭女子拳擊隊史首金,棒球對戰中國,舉重陳柏任、陳玟卉分頭作戰
- 中国消费者协会公布第三季度消费维权舆情热点:共享按摩椅设置不合理、现制饮品不能“去冰”等上榜
- 2024立委選戰倒數100天:泛藍泛綠搶出線,立委多腳督選區現分票危機
- iPhone 10你可以,但為何汽車新科技你不行?
- Google發表旗艦機Pixel 8系列:相機系統升級、Tensor G3晶片、結合生成式AI技術,台灣售價2.49萬元起
- 广州援疆医疗团队重点派驻项目启动调查,助力疏附县提升公共卫生应急处置能力
- 阿拉伯世界群起聲援巴勒斯坦、抗議以色列長期佔領,社群熱門標籤「巴勒斯坦是我的志業」
- 共享經濟時代:企業要用車,「租」絕對比「買」划算
- 電信業三強鼎立時代來臨:台台併公平會有條件通過,「新台灣大」拚年底前整併
- 整治农村人居环境助力文明城市创建
- 等等?改天?再約? 五大社交軟體拖延用語
- 如何在波動的市場中尋求收益?
- 歐洲央行暗示將大幅調整購債計劃?
- 克羅地亞議會宣布解散
- 《蒼蠅效應》:最不可思議之處在於——安慰劑什麼也沒做,卻還是產生了效果
- 第五屆走鐘獎週六登場:特別嘉賓河北彩花、紅毯主持換人引發熱議,這次典禮還有哪些必看重點?
- 《告別隱形傷痕》:「一定要……才行」是最不切實際的要求與期待
- 搜索
-
- 友情链接
-